Descrizione originale come Characodon variatus:
ZooBank:A36CE0A2-4AA1-4DD0-A7CB-0103CE339581.
- Bean, Tarleton Hoffman. 1887. "Descriptions of five new species of fishes sent by Prof. A. Dugès from the Province of Guanajuato, Mexico". Proceeding of the United States National Museum. 10(637):370-375 (ffm04505)
Conservazione: Xenotoca variata è valutata dalle organizzazioni internazionali di salvaguardia delle specie a rischio come (LC) basso rischio (2019).