Descripción original como Cyprinodon macrolepis:
- Miller, Robert Rush. 1976. "Four new pupfishes of the genus Cyprinodon from Mexico, with a key to the C. eximius complex". Bulletin of the Southern California Academy of Sciences. 75(2):68-75 (ffm00172)
Conservación: Cyprinodon macrolepis es evaluada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza en la lista roja de especies amenazadas como (EN) En peligro (1996).