Descripción original como Cyprinodon maya:
- Humphries, Julian & R.R. Miller. 1981. "A remarkable species flock of pupfishes, genus Cyprinodon, from Yucatán, Mexico". Copeia. 1981(1):52-64 (ffm00180) (resumen)
Conservación: Cyprinodon maya es evaluada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza en la lista roja de especies amenazadas como (EN) En peligro (1996). The negative impact of exotic species on the Lake Chichancanab Cyprinodon fauna has been documented by Strecker (2006).