Descripción original como Cyprinodon pachycephalus:
- Minckley, Wendell L & C.O. Minckley. 1986. "Cyprinodon pachycephalus, a new species of pupfish (Cyprinodontidae) from the Chihuahuan Desert of northern Mexico". Copeia. 1986(1):184-192 (ffm00183)
Conservación: Cyprinodon pachycephalus es evaluada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza en la lista roja de especies amenazadas como (CR) En peligro crítico (1996).