Descripción original como Cyprinodon verecundus:
- Humphries, Julian. 1984. "Cyprinodon verecundus, n. sp., a fifth species of pupfish from Laguna Chichancanab". Copeia. 1984(1):58-68 (ffm00193)
Conservación: Cyprinodon verecundus es evaluada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza en la lista roja de especies amenazadas como (CR) En peligro crítico (1996).