Descripción original como Fundulus punctatus:
ZooBank:E866F1F1-C36E-49B0-B573-8F836CA14EDA.
- Günther, Albert C. L. G. 1866. "Catalogue of the Physostomi, containing the families Salmonidae, Percopsidae, Galaxidae, Mormyridae, Gymnarchidae, Esocidae, Umbridae, Scombresocidae, Cyprinodontidae, in the collection of the British Museum". Catalogue of the fishes in the British Museum. 6:1-368 (ffm04521)
Sinónimos (2):
- Fundulus pachycephalus Günther, 1866, con localidad tipo en Guatemala. Certificador: Lazara, 2001
- Profundulus scapularis Fowler, 1936, con localidad tipo en Río Bravo, Hoca, Guatemala. Certificador: Doadrio et al., 1999
Conservación: Profundulus punctatus es evaluada por la Unión Internacional para la Conservación de la Naturaleza en la lista roja de especies amenazadas como (LC) Poca preocupación (2018).