Taxonomic Turmoil: Using ddRAD Data to Resolve Taxonomic Discrepancies Within the Genus Characodon (Cyprinodontiformes: Goodeidae)

摘要:

" Characodon（鯉齒目：吻鮈科）為源自墨西哥北部梅斯基塔爾河（Río Mezquital）流域的高度受脅魚類屬，包含兩個現存物種（C. lateralis 與 C. audax）以及一個已滅絕物種（C. garmani，僅見正模）。C. lateralis 與 C. garmani 之模式產地仍存不確定性，致使分類修訂具挑戰性。我們收集 ddRADSeq 資料，為該屬全分布範圍的族群建立全基因組層級的資料集。族群遺傳（FST、DAPC、PCA、sNMF）與親緣（ML）分析恢復出 Characodon 內部三個主要群/演化支，其中一群對應瀑布（Cascada El Saltito）上游，另兩群來自瀑布下游。以 BPP 進行的物種界定分析亦確認三群之存在。因此，我們在 Characodon 內承認四個物種。由於本研究未納入 C. garmani 樣本，無法基於遺傳資料重新評估其分類地位，故暫續予以承認。我們將梅斯基塔爾河流域瀑布上游其餘族群皆歸為 C. lateralis，並將 C. audax 視為次異名（junior synonym）。最後，承認瀑布下游尚有兩個未記載物種，Characodon sp. 1（Los Berros–La Constancia）與 Characodon sp. 2（Amado Nervo），有待正式描述. "