Swordtail fish hybrids reveal that genome evolution is surprisingly predictable after initial hybridization

摘要:

" 在过去 20 年中，生物学家逐渐认识到，杂交，即不同谱系之间的基因交换，出乎意料地普遍，不仅存在于某些特定谱系中，也存在于生命之树上的各类群体中。因此，许多现代物种的基因组中都包含从相关物种继承的区域。这一发现提出了根本性问题：杂交的基因组结果在多大程度上具有可重复性，以及自然选择在多大程度上推动这种可重复性。然而，缺乏适当的系统来回答这些问题限制了该领域的实证进展。在这里，我们利用剑尾鱼 Xiphophorus birchmanni 与 X. cortezi 独立形成的杂交种群来探讨这一基本问题。我们发现，一种杂交种群的局部祖先信息能高度预测另一种人口学上独立的杂交种群的局部祖先信息。通过应用新开发的方法，我们能够将这种重复性的大部分归因于初始杂交后早期世代中的强烈自然选择。我们还结合了时间序列数据，表明在受选择的区域中，祖先成分在大约 40 代的演化过程中保持稳定。最后，我们将结果与已深入研究的 X. birchmanni × X. malinche 杂交种群进行比较，并得出结论：物种间更深的进化分歧导致更强的选择，以及在 X. birchmanni 与 X. cortezi 杂交种群中局部祖先模式的更高重复性. "