Taxonomic Turmoil: Using ddRAD Data to Resolve Taxonomic Discrepancies Within the Genus Characodon (Cyprinodontiformes: Goodeidae)

Résumé:

" Characodon (Cyprinodontiformes : Goodeidae) est un genre de poissons gravement menacé du bassin du Río Mezquital, dans le nord du Mexique, comprenant deux espèces actuelles (C. lateralis et C. audax) ainsi qu’une troisième espèce éteinte (C. garmani), connue uniquement par l’holotype. Des incertitudes concernant les localités types de C. lateralis et C. garmani compliquent les révisions taxonomiques. Nous avons rassemblé des données ddRADSeq afin de constituer un jeu de données à l’échelle génomique pour des populations de Characodon sur l’ensemble de l’aire. Nos analyses de génétique des populations (FST, DAPC, PCA, sNMF) et phylogénétiques (ML) ont mis en évidence trois grands groupes/clades au sein de Characodon, dont un groupe correspondant à l’amont de la chute (Cascada El Saltito) et deux groupes distincts en aval. Les analyses de délimitation d’espèces avec BPP confirment l’existence de trois groupes. En conséquence, nous reconnaissons quatre espèces au sein de Characodon. Nous devons continuer à reconnaître C. garmani, puisque nous n’avons pas inclus d’échantillons et ne pouvons donc pas réévaluer son statut taxonomique sur base génétique. Nous reconnaissons toutes les autres populations en amont de la chute dans le bassin du Río Mezquital comme C. lateralis et considérons C. audax comme un synonyme plus récent (synonyme junior). Enfin, nous reconnaissons deux espèces non décrites en aval, Characodon sp. 1 (Los Berros–La Constancia) et Characodon sp. 2 (Amado Nervo), en attente de descriptions formelles. "