Décrit initialement sous Cyprinodon pachycephalus:
- Minckley, Wendell L & C.O. Minckley. 1986. "Cyprinodon pachycephalus, a new species of pupfish (Cyprinodontidae) from the Chihuahuan Desert of northern Mexico". Copeia. 1986(1):184-192 (ffm00183)
Conservation: Cyprinodon pachycephalus est évalué par l'Union Internationale pour la Conservation de la Nature dans la Liste Rouge des espèces menacées comme étant (CR) en danger critique (1996).